236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1076 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 
192 aa  378  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  58.42 
 
 
192 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  43.11 
 
 
207 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  44.83 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  38.82 
 
 
211 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  40.88 
 
 
205 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  39.66 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  40.45 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  34.68 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  37.57 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  39.01 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  37.43 
 
 
206 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  46.34 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  39.26 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.96 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  41.32 
 
 
212 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  40.96 
 
 
211 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  39.76 
 
 
211 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  39.76 
 
 
211 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  39.76 
 
 
211 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  39.76 
 
 
211 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  39.76 
 
 
211 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.76 
 
 
211 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  39.76 
 
 
211 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.76 
 
 
211 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  42.17 
 
 
211 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  40.7 
 
 
213 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  39.78 
 
 
210 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  32.62 
 
 
204 aa  121  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.78 
 
 
198 aa  120  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  36.09 
 
 
198 aa  120  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  32.12 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  30.06 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  40.78 
 
 
219 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  33.88 
 
 
203 aa  118  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.16 
 
 
208 aa  117  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  31.82 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  37.89 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.12 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  39.89 
 
 
216 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  33.72 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  37.5 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  38.55 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  40.68 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  30.94 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  31.43 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  34.81 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  32.79 
 
 
225 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  29.08 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  32.54 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  31.46 
 
 
209 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  33.54 
 
 
209 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  32.77 
 
 
203 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  30.95 
 
 
186 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  31.22 
 
 
200 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  104  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  34.88 
 
 
205 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  37.22 
 
 
197 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  39.6 
 
 
197 aa  102  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  28.24 
 
 
203 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  28.24 
 
 
203 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  28.24 
 
 
203 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  34.87 
 
 
192 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  37.78 
 
 
191 aa  101  7e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  25.82 
 
 
211 aa  101  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  32.99 
 
 
206 aa  100  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  27.71 
 
 
204 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  30.68 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  36.62 
 
 
172 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  31.44 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  40.36 
 
 
213 aa  98.2  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  40.36 
 
 
213 aa  98.2  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  29.38 
 
 
209 aa  97.8  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  32.58 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  25.71 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  31.93 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  30.99 
 
 
203 aa  96.3  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  38.33 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  37.4 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  32.02 
 
 
194 aa  96.3  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  34.42 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  39.44 
 
 
217 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  30.11 
 
 
197 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  27.06 
 
 
212 aa  94.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  29.55 
 
 
222 aa  95.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  35.82 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0720  Xaa-Pro dipeptidase  31.46 
 
 
194 aa  94.7  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  36.36 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  29.83 
 
 
194 aa  94.4  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  28.89 
 
 
204 aa  94.4  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  35.71 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  30.41 
 
 
204 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  30.18 
 
 
194 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  38.33 
 
 
217 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  25.71 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  30.43 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  25.71 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  33.77 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>