237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12728 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  424  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  50.51 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0003  hypothetical protein  55.39 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  47.74 
 
 		 204 aa  191  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  47.85 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  44.67 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  39.9 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  39.89 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  35.83 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  40.41 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  35.59 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  35.37 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.85 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  32.77 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  35.62 
 
 		 192 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  32.31 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  32.22 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  35.68 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  32.77 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  38.41 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  39.52 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  33.13 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  39.52 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  39.52 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  35.9 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.55 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  36.43 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  29.52 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  38.76 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  31.91 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  35.44 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  36.31 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  35.26 
 
 		 290 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  34.18 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  33.96 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.68 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  34.68 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  42.11 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  31.93 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  33.1 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  33.96 
 
 		 195 aa  99.4  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  31.58 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  28.92 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  28.99 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  32.56 
 
 		 195 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  42.28 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  29.52 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  35.4 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  36.23 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  32.56 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  40.15 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  37.69 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  36.77 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  29.73 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  33.54 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  39.39 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  36.88 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  38.66 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  35.16 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.39 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  32.67 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  39.39 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  32.11 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  36.54 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  32.19 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  32.56 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  35.82 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  35.44 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  31.79 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  37.88 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  37.88 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  37.88 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  37.88 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  37.88 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.88 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.88 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  33.54 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  39.29 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  34.93 
 
 		 203 aa  94.7  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  32.91 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  30.53 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  33.79 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  33.78 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  36.18 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  32.28 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  32.28 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  32.28 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  34.81 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  34.18 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  32.5 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  34.18 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  33.12 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  34.18 
 
 		 303 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.08 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  34.18 
 
 		 303 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  34.62 
 
 		 303 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>