238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0180 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  62.74 
 
 		 219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  47.09 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  45.15 
 
 		 211 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  46.12 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  46.12 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  45.63 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  45.63 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  45.63 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  45.63 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  45.63 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  44.66 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  45.37 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  44.98 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  46.92 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  44.17 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  43.08 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  40.67 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  40.58 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  43.54 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  37.38 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  46.39 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2997  protein of unknown function UPF0029  44.39 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  37.7 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  46.91 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  37.5 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  39.41 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  44.72 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  37.21 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.66 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  37.88 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  37.11 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  36.65 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  38.61 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  42.23 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00800  hypothetical protein  41.03 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.438932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  36.08 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  38.02 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  36.59 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  37.14 
 
 		 200 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  41.28 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  39.27 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  39.89 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  38.59 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  38.82 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14920  hypothetical protein  41.62 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0239804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  34.76 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  38.14 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  32.71 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  36.92 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  35.6 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0903  protein of unknown function UPF0029  40.7 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.30398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  34.57 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  35.05 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  36.92 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  39.53 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  33.97 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  35.86 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.02 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.62 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  38.38 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  36.04 
 
 		 205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.07 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1690  hypothetical protein  38.73 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  39.22 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  34.38 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  39.08 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  42.07 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  34.38 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  34.52 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  33.85 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  36.81 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  45.1 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  34.95 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  35.67 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  34.38 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  37.16 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  37.17 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  39.13 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  36.07 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  31.28 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.52 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  35.53 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.81 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  36.77 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  36.21 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  34.87 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  34.43 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  40.88 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  39.77 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  32.12 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  41.96 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  35.88 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.93 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  30.77 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  31.82 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  31.82 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0249  uncharacterized protein, YigZ family  38.5 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>