236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0124 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  44 
 
 
201 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  48.31 
 
 
203 aa  174  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  40.1 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  39.9 
 
 
203 aa  160  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  41.28 
 
 
200 aa  148  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  43.18 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0003  hypothetical protein  45.45 
 
 
210 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606692  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  38.89 
 
 
198 aa  135  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  38.98 
 
 
207 aa  135  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  45 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.51 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  38.83 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.06 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.37 
 
 
198 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  40.59 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  38 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  41.14 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  40.78 
 
 
194 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  36.14 
 
 
211 aa  121  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  31.84 
 
 
212 aa  121  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  41.14 
 
 
212 aa  121  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  34.5 
 
 
211 aa  121  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  34.5 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.2 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  36.17 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  40.78 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  40.68 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  39.56 
 
 
195 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  38.14 
 
 
216 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  37.62 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  39.43 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  45.58 
 
 
201 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  34.94 
 
 
211 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  34.94 
 
 
211 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  34.94 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  34.94 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  34.94 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.94 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.94 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  34.94 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.94 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  37.06 
 
 
200 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  41.14 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  40.51 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.46 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  38.73 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  40.51 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  40.51 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  37.02 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  40.4 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  38.73 
 
 
239 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  37.58 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  39.01 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  39.01 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  38.73 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.37 
 
 
221 aa  111  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  36.97 
 
 
192 aa  111  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  34.78 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  34.31 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  40.59 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  38.41 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  37.97 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  31.75 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  40.59 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  40.59 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  38.24 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  39.87 
 
 
195 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  39.87 
 
 
195 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  34.09 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  32.45 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  32.45 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  38.01 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  41.33 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  32.45 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  32.99 
 
 
192 aa  108  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  40 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.85 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  36.61 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  41.03 
 
 
303 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.36 
 
 
233 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  32.11 
 
 
213 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  36.32 
 
 
209 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  35.37 
 
 
197 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  37.21 
 
 
194 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.91 
 
 
211 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  37.79 
 
 
290 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  35.98 
 
 
206 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  39.35 
 
 
222 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  33.99 
 
 
214 aa  105  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  34.27 
 
 
205 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  41.29 
 
 
218 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  31.58 
 
 
203 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  35.45 
 
 
201 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  35.52 
 
 
242 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00800  hypothetical protein  36.08 
 
 
219 aa  105  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.438932  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  47.2 
 
 
198 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  38.76 
 
 
206 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>