238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0415 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  77.36 
 
 		 213 aa  325  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  77.36 
 
 		 213 aa  325  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  48.34 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  47.55 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  47.32 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  46.34 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  46.27 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  46.34 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  46.34 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  45.85 
 
 		 211 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  45.37 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  45.37 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  45.37 
 
 		 211 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  45.37 
 
 		 211 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  45.37 
 
 		 211 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  42.65 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  46.56 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  44.5 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  42.49 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  45.03 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  38.42 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  42.65 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  42.78 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  53.85 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  42.02 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  38.25 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  45.79 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  39.47 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  43.96 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.56 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  40.5 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  45.21 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  43.54 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  40.51 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  40.19 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  36.27 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  37.75 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  39.18 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  41.57 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  39.04 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  45.5 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  40.45 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  44.97 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  46.53 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  34.55 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  41.67 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  33.65 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  35.83 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  37.57 
 
 		 194 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  38.02 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  42 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.13 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  45.62 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  39.31 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  45.52 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  34.25 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  39.02 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  37.04 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  35.33 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  35.14 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  35.33 
 
 		 197 aa  122  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  41.67 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  45.52 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  37.3 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  38.17 
 
 		 242 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  43.18 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  37.22 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  38.33 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  36.92 
 
 		 196 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  43.31 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  40.96 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  46.54 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  37.29 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  45.83 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  34.57 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  34.57 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  34.57 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  34.69 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.52 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.59 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  35.64 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  39.18 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  34.39 
 
 		 290 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.64 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  36.08 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  49.54 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  39.13 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  36.81 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  33.71 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  38.83 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  35.11 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  44.17 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  34.66 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  34.8 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  44.03 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  37.58 
 
 		 195 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  37.58 
 
 		 195 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>