238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0361 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  430  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  50.73 
 
 
221 aa  210  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  47.09 
 
 
211 aa  202  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  46.34 
 
 
211 aa  192  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  44.93 
 
 
211 aa  181  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  44.93 
 
 
211 aa  181  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.93 
 
 
211 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  45.41 
 
 
211 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  44.93 
 
 
211 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  44.93 
 
 
211 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.93 
 
 
211 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  45.41 
 
 
212 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.93 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  44.93 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  43.48 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  42.51 
 
 
211 aa  171  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  43.2 
 
 
214 aa  169  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  40 
 
 
208 aa  168  7e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  46.55 
 
 
213 aa  167  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  43.41 
 
 
209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  41.06 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  44.2 
 
 
209 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  42.41 
 
 
212 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  51.03 
 
 
207 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  36.95 
 
 
212 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  53.85 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  33.96 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  42.62 
 
 
212 aa  138  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.41 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  50.31 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  35.68 
 
 
290 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  43.48 
 
 
217 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  47.24 
 
 
207 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  40.12 
 
 
205 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  35.83 
 
 
225 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  34.16 
 
 
195 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  42.41 
 
 
217 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  39.38 
 
 
199 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  33.66 
 
 
195 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  37.07 
 
 
214 aa  122  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.25 
 
 
210 aa  122  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  39.78 
 
 
192 aa  122  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  43.59 
 
 
197 aa  122  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  41.06 
 
 
213 aa  121  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  41.06 
 
 
213 aa  121  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  35.48 
 
 
206 aa  121  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  34.18 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  31.5 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  37.17 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  35.18 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  38.3 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  35.68 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  35.18 
 
 
198 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  38.37 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  36.59 
 
 
219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  35.18 
 
 
203 aa  118  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  44.22 
 
 
204 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  35.18 
 
 
203 aa  118  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  35.18 
 
 
203 aa  118  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  33.67 
 
 
194 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  34.18 
 
 
194 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  32.51 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.38 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  36.99 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  42.25 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  33.69 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  39.62 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.38 
 
 
208 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  36.13 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  32.99 
 
 
211 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  39.63 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  41.61 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  35.48 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  38.38 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  32.49 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  45.8 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  36.71 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  42.25 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  35.12 
 
 
195 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  35.12 
 
 
195 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  35.12 
 
 
195 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  34.74 
 
 
200 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  40.56 
 
 
197 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  39.89 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  33.97 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  36.93 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  36.45 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  40.14 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  31.98 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  40.71 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  36.59 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  32.84 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  37.42 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  33.87 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.41 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  39.86 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  33.5 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  42.86 
 
 
233 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>