238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0030 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  411  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  88.78 
 
 
198 aa  370  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  77.16 
 
 
198 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  47.89 
 
 
198 aa  192  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  47.09 
 
 
206 aa  188  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  48.11 
 
 
201 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  42.25 
 
 
209 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  44.86 
 
 
201 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  148  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  38.5 
 
 
204 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  41.3 
 
 
290 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  37.99 
 
 
203 aa  141  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  37.99 
 
 
203 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  37.99 
 
 
203 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  37.99 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  39.08 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  39.2 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  37.84 
 
 
207 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  39.53 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  42.05 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  41.48 
 
 
194 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  37.16 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  40.91 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  36.84 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.83 
 
 
204 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  41.21 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  40.91 
 
 
195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  36.67 
 
 
204 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  35.8 
 
 
211 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  50 
 
 
207 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  35.29 
 
 
203 aa  125  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  40.91 
 
 
196 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  40.91 
 
 
303 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  40.91 
 
 
196 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  50 
 
 
207 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  39.89 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  40.91 
 
 
303 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  40.91 
 
 
303 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  37.63 
 
 
199 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  33.87 
 
 
209 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  39.77 
 
 
195 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  39.77 
 
 
195 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  39.77 
 
 
195 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  39.89 
 
 
195 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  35.63 
 
 
203 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  37.1 
 
 
212 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  43.05 
 
 
245 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  40.23 
 
 
197 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  40.8 
 
 
303 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.86 
 
 
213 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  36.79 
 
 
200 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  45.6 
 
 
195 aa  120  9e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  36.87 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  36.52 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  37.44 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  37.88 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  51.85 
 
 
232 aa  119  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  37.24 
 
 
222 aa  118  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  36.32 
 
 
204 aa  117  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  37.06 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  38.8 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  35.63 
 
 
274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  31.18 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  36.17 
 
 
206 aa  115  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3648  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.987474  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  35.84 
 
 
213 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  33.72 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  32.31 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  44.17 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  39.44 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  37.04 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  43.31 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  32.47 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  37.95 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  31.58 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  32.11 
 
 
204 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  34.39 
 
 
211 aa  112  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  42.06 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  40.94 
 
 
208 aa  112  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  32.11 
 
 
204 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  32.77 
 
 
211 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  35.52 
 
 
213 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  33.51 
 
 
200 aa  111  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  38.89 
 
 
196 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  36.32 
 
 
205 aa  111  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  34.95 
 
 
201 aa  111  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  34.57 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  34.31 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  34.92 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  41.27 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  36.16 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  50.48 
 
 
242 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  32.57 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  43.9 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  32.47 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  35.16 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  32.64 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>