236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2757 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  67.16 
 
 
209 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  52.11 
 
 
211 aa  221  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  52.11 
 
 
211 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  52.11 
 
 
211 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  52.63 
 
 
212 aa  221  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  52.11 
 
 
211 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  51.58 
 
 
211 aa  221  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  52.11 
 
 
211 aa  221  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  52.11 
 
 
211 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  52.11 
 
 
211 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  51.58 
 
 
211 aa  218  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  51.58 
 
 
211 aa  218  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  51.58 
 
 
211 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  57.07 
 
 
209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  51.05 
 
 
213 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  48.96 
 
 
212 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  46.83 
 
 
208 aa  182  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  44.08 
 
 
214 aa  180  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  51.31 
 
 
212 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  42.78 
 
 
211 aa  176  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  55.88 
 
 
199 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  43.35 
 
 
211 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  51.72 
 
 
206 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  55.19 
 
 
206 aa  167  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  46.55 
 
 
210 aa  167  8e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  45.03 
 
 
213 aa  162  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  49.41 
 
 
210 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  41.36 
 
 
207 aa  157  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  51.3 
 
 
231 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  48.54 
 
 
214 aa  151  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  40.67 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  49.08 
 
 
233 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  41.76 
 
 
221 aa  144  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  47.14 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  41.24 
 
 
219 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  41.84 
 
 
216 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  54 
 
 
215 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  42.44 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  45.16 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  45.16 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  35.87 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  48.15 
 
 
232 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  42.11 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  41.1 
 
 
192 aa  127  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  40.31 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.68 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  40.49 
 
 
205 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  41.43 
 
 
242 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  52.03 
 
 
200 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  41.36 
 
 
217 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  38.66 
 
 
218 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  41.99 
 
 
212 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.2 
 
 
208 aa  123  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  41.67 
 
 
204 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  41.27 
 
 
194 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  40.1 
 
 
195 aa  121  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  38.89 
 
 
204 aa  121  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  36.14 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  37.23 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  39.01 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  40.21 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  41.98 
 
 
204 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  39.88 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  43.84 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  39.88 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  39.88 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  39.39 
 
 
197 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  37.36 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  38.15 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  39.46 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  36.08 
 
 
203 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  40.12 
 
 
190 aa  115  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  42.6 
 
 
205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  35.84 
 
 
198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  41.67 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  40.11 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  42.51 
 
 
245 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  40.35 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  37.57 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0903  protein of unknown function UPF0029  42.5 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.30398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  36.22 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  39.41 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.42 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  38.55 
 
 
192 aa  113  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  39.37 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  40.61 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  38.69 
 
 
290 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  37.36 
 
 
195 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  34.41 
 
 
206 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  40.31 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  41.78 
 
 
192 aa  111  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  41.14 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  39.51 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  39.02 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  38.07 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  39.51 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  39.51 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>