237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1121 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  93.19 
 
 
191 aa  367  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  45.76 
 
 
197 aa  162  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  43.6 
 
 
200 aa  139  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  37.91 
 
 
205 aa  122  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  39.04 
 
 
207 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.06 
 
 
206 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  37.58 
 
 
232 aa  118  6e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.94 
 
 
198 aa  115  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  35.5 
 
 
198 aa  114  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  34.97 
 
 
195 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  38.41 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  39.86 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.08 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  39.86 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  39.86 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  41.78 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  37.04 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  37.25 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  39.88 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.71 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  35.5 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  41.45 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  32.73 
 
 
186 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  40.61 
 
 
218 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.02 
 
 
211 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  36.56 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  36.46 
 
 
211 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  36.46 
 
 
211 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.46 
 
 
211 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.46 
 
 
211 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  36.46 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  36.46 
 
 
211 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  36.46 
 
 
211 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  43.05 
 
 
213 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  40.43 
 
 
213 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  40 
 
 
201 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  36.65 
 
 
206 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  35.62 
 
 
203 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  40.51 
 
 
203 aa  106  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  37.57 
 
 
245 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  39.62 
 
 
211 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  36.46 
 
 
211 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  42.4 
 
 
198 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  35.98 
 
 
213 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  37.78 
 
 
216 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  35.2 
 
 
195 aa  104  6e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  35.58 
 
 
204 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  42.07 
 
 
216 aa  104  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  38 
 
 
211 aa  104  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.32 
 
 
210 aa  104  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1321  hypothetical protein  39.39 
 
 
202 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.353433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.18 
 
 
205 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0524  thymidylate synthase  40.51 
 
 
191 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.67 
 
 
211 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  38 
 
 
212 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  36.42 
 
 
195 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  37.04 
 
 
195 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  38.61 
 
 
208 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  36.97 
 
 
206 aa  102  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  37.27 
 
 
204 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  34.87 
 
 
192 aa  102  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  36.42 
 
 
195 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  39.31 
 
 
208 aa  101  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  46.72 
 
 
211 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  33.55 
 
 
200 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  33.56 
 
 
191 aa  101  8e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  42.03 
 
 
201 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  35.8 
 
 
195 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  34.12 
 
 
194 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  35.06 
 
 
203 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  32.53 
 
 
203 aa  100  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  35.06 
 
 
203 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  35.06 
 
 
203 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  42.25 
 
 
202 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0142  protein of unknown function UPF0029  39.04 
 
 
196 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  34.9 
 
 
225 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1726  protein of unknown function UPF0029  40.58 
 
 
216 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2202  hypothetical protein  39.37 
 
 
204 aa  100  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.480648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  39.58 
 
 
209 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  32.12 
 
 
206 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  33.71 
 
 
211 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0003  hypothetical protein  36.49 
 
 
210 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606692  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0720  Xaa-Pro dipeptidase  37.16 
 
 
194 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  35.17 
 
 
197 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  44.09 
 
 
210 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  34.73 
 
 
204 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  36.14 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0428  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  40.98 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.773422  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  35.37 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  38.27 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  35.56 
 
 
200 aa  99  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  32.89 
 
 
204 aa  98.6  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  41.67 
 
 
205 aa  99  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 
212 aa  99  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  37.59 
 
 
290 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  99  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  35.06 
 
 
176 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  34.64 
 
 
197 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  98.2  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>