236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3285 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  51.76 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  47.18 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  44.67 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  46.37 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0003  hypothetical protein  52.91 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606692  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  40.22 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  43.18 
 
 		 206 aa  142  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  43.68 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  34.62 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  33.69 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  39.74 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  43.85 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  32.09 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  36.02 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  38.46 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  42.25 
 
 		 192 aa  111  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  32.97 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  35.88 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  35.88 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  31.95 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  43.55 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  36.93 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  42.74 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  36.57 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  43.48 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  39.16 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  38 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  46.83 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  41.41 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  37.27 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  42.03 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  45.69 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  35.71 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  36.65 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  37.89 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  36.59 
 
 		 290 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  33.92 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  43.48 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  38.61 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  39.22 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  38.61 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  38.61 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  44.35 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  40.67 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  38.62 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  36.05 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  34.18 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  30.61 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  34.52 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  33.14 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  42.03 
 
 		 195 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1726  protein of unknown function UPF0029  40.46 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  33.54 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  35.47 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  38.65 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  32.58 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  44.34 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  44.44 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.49 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  39.87 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  31.35 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  31.46 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  44.44 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  32.97 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  35.48 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  44.2 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  44.2 
 
 		 303 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  32 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  44.2 
 
 		 303 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  35.5 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  44.2 
 
 		 303 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  44.2 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  44.2 
 
 		 303 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  33.73 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.18 
 
 		 233 aa  97.8  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  47.47 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.17 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  43.55 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  33.75 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  40.14 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  37.32 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  33.75 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  37.97 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  34.97 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  42.99 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0142  protein of unknown function UPF0029  34.68 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  33.12 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1690  hypothetical protein  37.43 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  33.56 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  33.56 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  34.44 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  32.8 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  35.76 
 
 		 214 aa  94.7  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  31.32 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  35.71 
 
 		 195 aa  94.7  7e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  33.12 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>