234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1183 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  56.15 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  43.6 
 
 
192 aa  139  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  44.19 
 
 
191 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  39.36 
 
 
205 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  43.02 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  42.44 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  42.94 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  45.62 
 
 
213 aa  124  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  52.03 
 
 
213 aa  124  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  39.87 
 
 
212 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  48.84 
 
 
203 aa  122  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  41.38 
 
 
211 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  41.38 
 
 
211 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.8 
 
 
211 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  42.48 
 
 
207 aa  121  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  40.8 
 
 
211 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  40.48 
 
 
209 aa  121  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  40.12 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  38.66 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  40.8 
 
 
211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  40.8 
 
 
211 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  40.8 
 
 
211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.8 
 
 
211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.8 
 
 
211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  42.21 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  42 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.08 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0142  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  36.53 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  49.59 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  46.67 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  43.26 
 
 
216 aa  111  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  49.59 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  53.77 
 
 
221 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  49.55 
 
 
210 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  44.88 
 
 
204 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  42.16 
 
 
219 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  39.07 
 
 
210 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  40.29 
 
 
205 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  49.06 
 
 
211 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  34.5 
 
 
212 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  42.74 
 
 
194 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  38.52 
 
 
211 aa  101  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  49.19 
 
 
214 aa  101  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  38.37 
 
 
212 aa  101  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  38.38 
 
 
216 aa  101  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  41.94 
 
 
206 aa  101  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  41.94 
 
 
194 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  41.94 
 
 
205 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  41.94 
 
 
194 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  37.32 
 
 
195 aa  100  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  38.71 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  42.86 
 
 
206 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  40.46 
 
 
274 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  35 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  45.08 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  45.89 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1726  protein of unknown function UPF0029  40.94 
 
 
216 aa  99.4  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  43.2 
 
 
205 aa  99  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  32.35 
 
 
201 aa  99  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  47.66 
 
 
242 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  42.6 
 
 
216 aa  98.2  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  44.35 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  55.56 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  55.56 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0720  Xaa-Pro dipeptidase  40.8 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  41.73 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  32.16 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  36.16 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  31.61 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  33.76 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  39.26 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  43.59 
 
 
232 aa  94.4  9e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  36.36 
 
 
192 aa  94.7  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  36.75 
 
 
219 aa  94.4  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  35.4 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  32.09 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  35.93 
 
 
212 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  41.94 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  32.08 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0428  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  40 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.773422  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  36.57 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  40 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.92 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  46.39 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  38.52 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  32.52 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  31.72 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0903  protein of unknown function UPF0029  39.24 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.30398 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  40.59 
 
 
218 aa  91.3  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  43.52 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  29.28 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  41.61 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  45.36 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  34.23 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  41.13 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  43.81 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  29.7 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>