236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6009 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 		 239 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  96.89 
 
 		 194 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  80.93 
 
 		 290 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  77.72 
 
 		 204 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  75.92 
 
 		 195 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  75.92 
 
 		 195 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  75.92 
 
 		 195 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  74.74 
 
 		 195 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  74.35 
 
 		 195 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  73.82 
 
 		 195 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  74.49 
 
 		 213 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  79.06 
 
 		 196 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  79.06 
 
 		 196 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  79.06 
 
 		 303 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  71.65 
 
 		 194 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  79.06 
 
 		 303 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  79.06 
 
 		 303 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  74.21 
 
 		 195 aa  277  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  72.63 
 
 		 195 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  71.94 
 
 		 245 aa  274  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  71.58 
 
 		 194 aa  274  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  79.06 
 
 		 303 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  53.68 
 
 		 200 aa  201  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  60.36 
 
 		 197 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  60.36 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  56.61 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  54.21 
 
 		 206 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  57.14 
 
 		 197 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  57.89 
 
 		 196 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  53.63 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  54.71 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3648  hypothetical protein  54.84 
 
 		 197 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.987474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  43.35 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  41.97 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  43.65 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  42.41 
 
 		 206 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  38.66 
 
 		 219 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  42.44 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  39.53 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  40.82 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  41.3 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  35.26 
 
 		 211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35.08 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  38.02 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  38.02 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  38.02 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  38.54 
 
 		 203 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  39.2 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  35.14 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  39.89 
 
 		 197 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  41.88 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  39.15 
 
 		 203 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  37.5 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  42.37 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  38.83 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  41.81 
 
 		 196 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  41.76 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  33.99 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  37.04 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.2 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  40.68 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  36.6 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  37.77 
 
 		 200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  41.08 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  38.98 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  32.51 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  32.28 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  35.64 
 
 		 193 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  39.36 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  33.67 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  35.15 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  40.62 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0592  protein of unknown function UPF0029  42.19 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.655997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  34.18 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  40.74 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  35.6 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  40.74 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  32.11 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  34.54 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  34.36 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  34.9 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  32.16 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  32.16 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  39.46 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.66 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  40.11 
 
 		 194 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  32.16 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  32.16 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  29.95 
 
 		 197 aa  111  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.16 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  40.11 
 
 		 194 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  32.16 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.16 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  36.26 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.38 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  38.5 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  32.63 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>