233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2975 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  68.69 
 
 
207 aa  286  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  67.68 
 
 
207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  62 
 
 
210 aa  238  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  55.05 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  59.09 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  59.09 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  59.09 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  55.74 
 
 
203 aa  208  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  53.65 
 
 
203 aa  204  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  51.91 
 
 
204 aa  200  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  50 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  51.7 
 
 
204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  49.46 
 
 
207 aa  191  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  51.53 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  51.53 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  58.62 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  51.53 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  51.53 
 
 
204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  51.53 
 
 
204 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  50.51 
 
 
204 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  50.51 
 
 
204 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  50.51 
 
 
205 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  50.51 
 
 
205 aa  180  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  50.51 
 
 
204 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  50.51 
 
 
205 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  50.51 
 
 
205 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  50.51 
 
 
205 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  55.11 
 
 
209 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  44.39 
 
 
211 aa  174  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  43.5 
 
 
204 aa  168  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  46.15 
 
 
204 aa  167  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  42.5 
 
 
204 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  41.29 
 
 
204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  44.25 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  41.79 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  40.1 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  46.37 
 
 
204 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  41.29 
 
 
204 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  45.81 
 
 
204 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  40.8 
 
 
204 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  47.45 
 
 
202 aa  158  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  43.09 
 
 
205 aa  157  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  44.69 
 
 
204 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  47.06 
 
 
176 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  42.57 
 
 
205 aa  154  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  41.41 
 
 
242 aa  151  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  39.47 
 
 
204 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  41.33 
 
 
219 aa  147  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  41.53 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.44 
 
 
198 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.61 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  38.33 
 
 
274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  36.6 
 
 
211 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  37.16 
 
 
198 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  44.51 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  40 
 
 
208 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  38.8 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  36.27 
 
 
211 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  38.65 
 
 
208 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  38.71 
 
 
211 aa  121  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  36.7 
 
 
214 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  38.1 
 
 
209 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  44.22 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  41.98 
 
 
213 aa  118  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  44.16 
 
 
211 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  38.69 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.17 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  37.63 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  36.31 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  34.22 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  37.22 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  44.03 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  41.26 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  36.17 
 
 
190 aa  112  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  40.56 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  35.11 
 
 
212 aa  111  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.29 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  37.82 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  40.29 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  36.11 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  40.14 
 
 
207 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  39.57 
 
 
211 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  37.66 
 
 
211 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  39.57 
 
 
211 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  39.57 
 
 
211 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  37.66 
 
 
211 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.57 
 
 
211 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.57 
 
 
211 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  45.19 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.33 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  33.51 
 
 
196 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  32.65 
 
 
239 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  43.36 
 
 
209 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  34.54 
 
 
196 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  32.98 
 
 
204 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  35.12 
 
 
212 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  36.93 
 
 
194 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  30.61 
 
 
200 aa  104  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>