237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1280 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 		 214 aa  435  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  52.82 
 
 		 231 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  45.88 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  44.71 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  44.71 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  44.12 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.12 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  43.53 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  44.12 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  44.12 
 
 		 211 aa  158  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.12 
 
 		 211 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.12 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  48 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  48.54 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  43.53 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  44.19 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  43.6 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  45.61 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  39.6 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  43.55 
 
 		 212 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  46.78 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  47.4 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  47.27 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  45.52 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  38.5 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  39.38 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  37.07 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  34.47 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  40.88 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  42.51 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  43.55 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  37.7 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  41.28 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  44.6 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  33.17 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  51.33 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  48.94 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  50.67 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.02 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  41.21 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  36.56 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  42.95 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  39.26 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  42.14 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  43.26 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  43.15 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  43.27 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.14 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  43.67 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  39.77 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  31.79 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  37.16 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  31.48 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  42.69 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  37.78 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  36.79 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  33.68 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  42.68 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  41.55 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  41.55 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  34.57 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  37.29 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  41.55 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.97 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  41.24 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  35.91 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  49.19 
 
 		 200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  44.8 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  41.62 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  36.97 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  34.3 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  41.62 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  41.62 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  36.9 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  41.62 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  35.15 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  40.34 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  38.04 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  47.2 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  42.68 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  36.98 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  43.05 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  41.81 
 
 		 303 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  36.51 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  41.94 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  41.81 
 
 		 303 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  37.65 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  41.81 
 
 		 303 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  41.81 
 
 		 303 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  38.46 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  40.59 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  43.45 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  42.44 
 
 		 196 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  42.44 
 
 		 196 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  38.24 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  44.24 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  39.53 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  41.34 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>