235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0084 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  48.72 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  51.22 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  44.39 
 
 		 211 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  48.96 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  42.86 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.37 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  42.35 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  42.35 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  42.35 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  42.35 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  42.35 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  42.35 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  42.86 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  42.86 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  42.27 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  47.74 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  47.57 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.55 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  42.69 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  38.42 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  39.22 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  36.45 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  51.37 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  36.95 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  54.32 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.75 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  47.34 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  51.45 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  43.37 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  42.33 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  33.67 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  37.97 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  42.41 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  42.16 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.5 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  38.68 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  43.55 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  39.67 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  39.67 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  37.82 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  39.67 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.62 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  41.85 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  54.23 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  44.22 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  37.75 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  41.08 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  37.11 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  37.11 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  44.62 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  37.95 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  37.1 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  40.21 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  37.08 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  42.01 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  43.46 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  36.92 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  37.1 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  44.55 
 
 		 232 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  36.05 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  41.27 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  39.8 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  30.99 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  35.68 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  30.06 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  43.63 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  37.3 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  37.57 
 
 		 204 aa  117  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  38.71 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  41.14 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  38.95 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  39.55 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  36.22 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  35.06 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.14 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  38.98 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  38.73 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  38.41 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  31.21 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  41.18 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  29.9 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  41.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  41.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  38.98 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  41.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  41.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  36.53 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  41.21 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  41.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  45.07 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  41.21 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  39.76 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  41.62 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  36.81 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  29.38 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  41.52 
 
 		 205 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  42.28 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  41.62 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  41.62 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>