236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1241 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  394  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  56.15 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  45.76 
 
 
192 aa  162  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  44.83 
 
 
191 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  47.4 
 
 
205 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  42.11 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  43.75 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  41.86 
 
 
213 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  41.51 
 
 
203 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  40.83 
 
 
211 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  44 
 
 
212 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  40.37 
 
 
211 aa  122  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  37.87 
 
 
209 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  43.59 
 
 
210 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  42.6 
 
 
211 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  40.94 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  40.94 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  42.76 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  40.51 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.51 
 
 
211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  38.76 
 
 
211 aa  119  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  41.14 
 
 
211 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  41.14 
 
 
211 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.14 
 
 
211 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.14 
 
 
211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  40.51 
 
 
211 aa  118  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  37.99 
 
 
211 aa  117  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  46.54 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  34.95 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  41.45 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  39.39 
 
 
213 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  40.72 
 
 
207 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  47.86 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  38.41 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  44.85 
 
 
214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.28 
 
 
208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  36.14 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  35.47 
 
 
204 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1726  protein of unknown function UPF0029  41.72 
 
 
216 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  41.22 
 
 
274 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  41.18 
 
 
195 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  35.67 
 
 
211 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  37.66 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  37.66 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  37.66 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  43.15 
 
 
214 aa  107  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  43.84 
 
 
208 aa  106  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0142  protein of unknown function UPF0029  40.58 
 
 
196 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  32.37 
 
 
204 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  105  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  43.75 
 
 
242 aa  104  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  33.54 
 
 
212 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  52 
 
 
192 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  39.6 
 
 
192 aa  102  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  33.55 
 
 
204 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  36.62 
 
 
210 aa  102  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  32.76 
 
 
204 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  33.13 
 
 
225 aa  101  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  41.18 
 
 
207 aa  101  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  35.52 
 
 
233 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  40.34 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  35.12 
 
 
204 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  39.34 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  34.59 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  36.13 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  36.36 
 
 
219 aa  99  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  38.31 
 
 
198 aa  99  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  36.92 
 
 
206 aa  98.2  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  41.3 
 
 
232 aa  98.2  7e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  35.53 
 
 
199 aa  97.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  46.09 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  31.03 
 
 
233 aa  97.1  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  42.95 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  42.95 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  32.92 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  33.93 
 
 
195 aa  96.3  3e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  32.67 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.53 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  40.88 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  40.15 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  33.73 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  39.26 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  37.76 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  32.54 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  40.44 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.11 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  37.5 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  43.75 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  41.21 
 
 
218 aa  94.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  39.16 
 
 
202 aa  94.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  35.06 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  44.08 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  36.91 
 
 
200 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  32.67 
 
 
209 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  42.61 
 
 
194 aa  94  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  36.81 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  31.45 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  39.66 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  36.3 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  37.04 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>