236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1608 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  64.62 
 
 		 212 aa  261  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  60.44 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  49.21 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  52.91 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  50.53 
 
 		 195 aa  185  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  48.15 
 
 		 197 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  50.52 
 
 		 196 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  49.74 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  46.35 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  46.88 
 
 		 194 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  43.75 
 
 		 193 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  46.88 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  46.88 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  48.65 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0091  hypothetical protein  50.81 
 
 		 194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  47.67 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  47.67 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  45.6 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3312  hypothetical protein  45.6 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4327  hypothetical protein  44.39 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0074  hypothetical protein  51.35 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  36.36 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  40.22 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37283  predicted protein  44.81 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  42.42 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  40.98 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  40.22 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  42.42 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  42.56 
 
 		 194 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  42.35 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  42.27 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  42.71 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  41.58 
 
 		 195 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  40.22 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  38.58 
 
 		 290 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  41.58 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  38.95 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.97 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  41.05 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  40.84 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  38.38 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  37.93 
 
 		 213 aa  118  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  38.86 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  39.3 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  38.66 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  40.22 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  38.66 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  39.47 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  38.34 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  35.75 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  35.75 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  35.75 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  41.33 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  42.86 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  37.17 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  45.71 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  45.71 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  45.71 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  37.7 
 
 		 213 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  34.72 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  33.72 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  43.04 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  36.22 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  47.86 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  37.17 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  47.86 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  43.48 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  38.67 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  36.41 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  41.92 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  47.86 
 
 		 303 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  37.91 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  32.09 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  47.86 
 
 		 303 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  47.86 
 
 		 303 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  47.86 
 
 		 303 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.97 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  36.65 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  42.16 
 
 		 210 aa  107  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  36.55 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  42.03 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  34.02 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  40.58 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  33.14 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  36.6 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  35.53 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  33.68 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  30.81 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  33.49 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  48.31 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  48.18 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  40.49 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  34.5 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  38.42 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>