236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0246 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  436  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  47.09 
 
 
210 aa  202  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  47.06 
 
 
211 aa  192  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  44.5 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  42.78 
 
 
213 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  45.19 
 
 
214 aa  175  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  42.35 
 
 
208 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  43.81 
 
 
209 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  44.76 
 
 
211 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  43.33 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.33 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  43.33 
 
 
211 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  43.33 
 
 
211 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  43.33 
 
 
211 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.33 
 
 
211 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  43.48 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  43.48 
 
 
211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  43.81 
 
 
211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.33 
 
 
211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  42.86 
 
 
211 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  43.69 
 
 
213 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  41.12 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  42.02 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  38.02 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  40 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  42.46 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  41.83 
 
 
216 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  37.97 
 
 
212 aa  141  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  37.02 
 
 
206 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  35.2 
 
 
211 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  44.44 
 
 
199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  37.57 
 
 
201 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  35.03 
 
 
242 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  42.5 
 
 
216 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  38.27 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  39.11 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  40.72 
 
 
194 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  35.26 
 
 
239 aa  131  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  35.98 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  35.57 
 
 
290 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  35.45 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  35.35 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  34.03 
 
 
274 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  34.92 
 
 
195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.55 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  34.74 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  35.42 
 
 
213 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  39.01 
 
 
192 aa  128  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  34.25 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  38.18 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  38.18 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  38.18 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  34.25 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  34.25 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  37.95 
 
 
201 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  39.52 
 
 
206 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  39.38 
 
 
214 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  36.02 
 
 
207 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  36.27 
 
 
204 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  38.18 
 
 
195 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  32.79 
 
 
204 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  35.06 
 
 
206 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.2 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.36 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  43.86 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  34.03 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  32.96 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  34.76 
 
 
225 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  39.08 
 
 
212 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  33.17 
 
 
207 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  33.52 
 
 
205 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  34.54 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  35.98 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  37.99 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  34.54 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  37.24 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  37.65 
 
 
303 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  39.36 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  34.54 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  37.95 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  38.04 
 
 
303 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  34.54 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  37.95 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  37.62 
 
 
212 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  35.79 
 
 
198 aa  115  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  35.48 
 
 
190 aa  115  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  32.11 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  39.39 
 
 
191 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  35.35 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  40.8 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.39 
 
 
198 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  36.36 
 
 
232 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  35.23 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  37.43 
 
 
197 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  35.06 
 
 
198 aa  111  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>