233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3931 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  80.79 
 
 		 204 aa  336  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  63.37 
 
 		 204 aa  270  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  66.34 
 
 		 203 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  64.04 
 
 		 204 aa  268  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  65.84 
 
 		 203 aa  262  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  61.08 
 
 		 204 aa  260  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  64.36 
 
 		 205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  64.85 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  64.85 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  64.36 
 
 		 205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  64.85 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  64.85 
 
 		 204 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  64.85 
 
 		 204 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  64.36 
 
 		 204 aa  251  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  65.35 
 
 		 204 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  65.35 
 
 		 204 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  65.35 
 
 		 204 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  65.35 
 
 		 204 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  65.35 
 
 		 204 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  65.35 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  59.09 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  58.06 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  53 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  51.74 
 
 		 207 aa  201  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  47.47 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  45.96 
 
 		 204 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  46.46 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  47.24 
 
 		 204 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  45.96 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  47.69 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  44.16 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  46.46 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  46.73 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  46.46 
 
 		 204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  52 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  46.91 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  51.53 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  45.45 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  45.23 
 
 		 204 aa  177  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  49.71 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  43.15 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  43.94 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  44.9 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  41.5 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  41.71 
 
 		 205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  45.77 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  41.27 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  38.22 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  37 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  38 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  38.5 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  39.29 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  42.05 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  37.99 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  39.9 
 
 		 194 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  39.39 
 
 		 194 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  38.12 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.87 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  40.5 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  40.82 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  39.09 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  39.67 
 
 		 212 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  40 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  37.95 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  37.37 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  37.22 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  38.02 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  39.23 
 
 		 290 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  34.25 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  38.89 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  36.13 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  36.87 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  38.33 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  38.07 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  38.89 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  37.63 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  37.56 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.32 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  38.8 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  42.86 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  39.29 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  38.92 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  36.36 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  38.8 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  37.06 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2485  protein of unknown function UPF0029  40.51 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  36.7 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  37.22 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  37.22 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  37.22 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  39.8 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  42.08 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  36.27 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>