233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0251 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  61.83 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  61.83 
 
 		 194 aa  229  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  59.14 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0720  Xaa-Pro dipeptidase  55.91 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2202  hypothetical protein  55.08 
 
 		 204 aa  204  8e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.480648  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0428  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  53.33 
 
 		 211 aa  204  9e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.773422  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1712  protein of unknown function UPF0029  47.12 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0077  hypothetical protein  52.6 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0524  thymidylate synthase  47.03 
 
 		 191 aa  154  7e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  34.01 
 
 		 207 aa  117  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  34.81 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  33.16 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  33.69 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  34.97 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  34.25 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  36.97 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  36.97 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  36.97 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  37.66 
 
 		 290 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  32.04 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  33.69 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  35.63 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  36.36 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.16 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  37.65 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  33.88 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  34.41 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  39.31 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  37.29 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  32.69 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  36 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  38 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  37.33 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  37.33 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  32.56 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.33 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  36.13 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  37.33 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  40.14 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  37.33 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.67 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  35.9 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  29.14 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  34.09 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.33 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  32.34 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  34.09 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  30.93 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  32.09 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  35.54 
 
 		 214 aa  98.2  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  29.67 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  32.75 
 
 		 211 aa  97.8  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  29.44 
 
 		 216 aa  97.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  36.92 
 
 		 190 aa  97.8  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  31.74 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  36.08 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  34.59 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  30.93 
 
 		 222 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  36.62 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  34.55 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  36 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  37.06 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  40.32 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  44.35 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  33.14 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  31.14 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.22 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  38.76 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  37.33 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  32.26 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  39.52 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  37.66 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  31.14 
 
 		 204 aa  94.4  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  30.6 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  31.79 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  33.7 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  36.47 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  36.05 
 
 		 303 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  31.58 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1726  protein of unknown function UPF0029  30.72 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  36.05 
 
 		 303 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  42.73 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  36.47 
 
 		 303 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  36.47 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  36.05 
 
 		 303 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  41.94 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  28.72 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  38.76 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  34.5 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  31.55 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  32.48 
 
 		 209 aa  92  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  40.14 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  36.43 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  32.35 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  29.94 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>