232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0077 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0077  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2202  hypothetical protein  57.35 
 
 
204 aa  249  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.480648  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0428  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  51.44 
 
 
211 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.773422  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  52.6 
 
 
193 aa  192  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1712  protein of unknown function UPF0029  47.18 
 
 
196 aa  190  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  47.06 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  46.52 
 
 
194 aa  170  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  46.52 
 
 
194 aa  168  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0720  Xaa-Pro dipeptidase  44.92 
 
 
194 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0524  thymidylate synthase  52.41 
 
 
191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  36.52 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  37.82 
 
 
212 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  43.08 
 
 
192 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  38.31 
 
 
191 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.34 
 
 
211 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  35.26 
 
 
195 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  35.19 
 
 
206 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  35.48 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  50.48 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  36.62 
 
 
290 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  34.72 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  48.57 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  32.32 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  35.42 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  47.62 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  35.42 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  49.52 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  34.36 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  35.42 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  34.72 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  48.57 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  39.53 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  36.81 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  35.42 
 
 
195 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  35.57 
 
 
195 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  48.57 
 
 
176 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  48.57 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  36.54 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  36.11 
 
 
194 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  32.14 
 
 
197 aa  95.5  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  48.57 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  32.14 
 
 
222 aa  95.5  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  34.9 
 
 
195 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  34.19 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  35.42 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  42.24 
 
 
190 aa  94  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  32.47 
 
 
205 aa  94  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  34.19 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  47.62 
 
 
204 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  34.19 
 
 
303 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  31.64 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  36.6 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  28.09 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  37.06 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  36.11 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  34.19 
 
 
303 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  34.19 
 
 
303 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  34.19 
 
 
303 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  37.65 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  48.11 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  30.65 
 
 
198 aa  92  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  46.49 
 
 
208 aa  92  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  32.6 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  47.62 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  35.22 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  35.22 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  30.68 
 
 
201 aa  91.3  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  35.22 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  31.98 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  30.51 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  33.8 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  42.4 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  38.17 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  41.23 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  33.13 
 
 
209 aa  89  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  40.32 
 
 
197 aa  89.4  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  44.26 
 
 
232 aa  89  5e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  40 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  39.32 
 
 
245 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  30.5 
 
 
214 aa  88.2  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.84 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  32.28 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  38.79 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  32.88 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1726  protein of unknown function UPF0029  31.29 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  34.03 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  37.7 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  38.21 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  34.53 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  29.57 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.9 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  34.97 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  36.15 
 
 
186 aa  85.9  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  31.9 
 
 
212 aa  85.5  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  36.92 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0091  hypothetical protein  32.63 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  34.46 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  29.55 
 
 
198 aa  85.1  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  37.7 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  34.46 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>