236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0091 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0091  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3312  hypothetical protein  63.59 
 
 		 209 aa  234  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  62.18 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  62.18 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  58.38 
 
 		 196 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  57.84 
 
 		 196 aa  214  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4327  hypothetical protein  57.45 
 
 		 199 aa  200  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  54.1 
 
 		 206 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  48.95 
 
 		 193 aa  194  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  47.37 
 
 		 197 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  46.84 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  49.44 
 
 		 194 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  49.47 
 
 		 195 aa  185  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  48.15 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  50.53 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  48.15 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  48.15 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  51.67 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  48.35 
 
 		 212 aa  167  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  46.39 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  43.16 
 
 		 200 aa  150  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  41.21 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  40.74 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  39.01 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  40.41 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  42.11 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  39.9 
 
 		 195 aa  124  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  39.15 
 
 		 239 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  38.42 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  37.7 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  40.72 
 
 		 245 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  33.33 
 
 		 232 aa  121  7e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  38.02 
 
 		 290 aa  121  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  37.63 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  39.59 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  41.01 
 
 		 195 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37283  predicted protein  40.84 
 
 		 239 aa  117  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118938  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  40.45 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  44.12 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  38.3 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  38.83 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0074  hypothetical protein  47.59 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  34.83 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  39.89 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  39.89 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  39.89 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  35.79 
 
 		 242 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  37.43 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  35.52 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  41.52 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  35.52 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  35.52 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  38.31 
 
 		 303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  37.57 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  35.75 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.87 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  39.09 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  35.42 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  39.09 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  34.9 
 
 		 207 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  35.83 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.65 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  38.31 
 
 		 303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  38.31 
 
 		 303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  41.67 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  32.8 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  43.07 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  40.35 
 
 		 303 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  36.67 
 
 		 206 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  32.45 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  39.72 
 
 		 198 aa  104  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  40.13 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  30.57 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  38.57 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  33.7 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  31.46 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  40.58 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  32.63 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  37.91 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  32.58 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  37.97 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  41.26 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  31.94 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  35.91 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  28.32 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  41.09 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  34.86 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  41.26 
 
 		 222 aa  101  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  31.84 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  36.32 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  35.6 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  32.63 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  35.79 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  34.38 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  37.91 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  30.41 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  38.04 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  35.1 
 
 		 205 aa  99  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>