233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0025 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  83.17 
 
 		 211 aa  361  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  70.94 
 
 		 204 aa  322  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  67.65 
 
 		 204 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  67.49 
 
 		 204 aa  294  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  67.82 
 
 		 204 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  67.49 
 
 		 204 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  67 
 
 		 204 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  67 
 
 		 204 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  67.49 
 
 		 204 aa  292  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  65.52 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  63.86 
 
 		 204 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  65.52 
 
 		 204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  62.87 
 
 		 208 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  69.89 
 
 		 176 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  60.89 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  48.9 
 
 		 205 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  44.9 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  44.9 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  44.9 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  44.9 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  46.15 
 
 		 204 aa  167  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  42.78 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  44.9 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  45.45 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  45.45 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  45.45 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  45.45 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  45.45 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  40.51 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  44.39 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  44.39 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  44.39 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  40.51 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  44.39 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  44.39 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  44.9 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  44.9 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  44.9 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  38.19 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  37.06 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  42.86 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  43.41 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  38.97 
 
 		 203 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  42.78 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  43.26 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  38.5 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  36.93 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  35.64 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  40.91 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  41.38 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  33.71 
 
 		 201 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  36.26 
 
 		 274 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  36.68 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  29.41 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  33.7 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.88 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  46.4 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.23 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  32.11 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  30.85 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  34.17 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  33.51 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  34.43 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  31.98 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  33.85 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  35.35 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  31.61 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0592  protein of unknown function UPF0029  38.66 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.655997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  32.26 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  31.61 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  34.87 
 
 		 290 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0695  hypothetical protein  38.1 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  33.85 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1321  hypothetical protein  35.64 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.353433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  32.74 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  31.98 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  33 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  35.47 
 
 		 232 aa  99.4  3e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  35.67 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  31.77 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  35.93 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  31.87 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  33.15 
 
 		 195 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  32.07 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  33.15 
 
 		 195 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  33.15 
 
 		 195 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  35.43 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  33.7 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  34.78 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  39.2 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  32.8 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  29.73 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  31.75 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  35.2 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2485  protein of unknown function UPF0029  35.35 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  37.67 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>