237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1335 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  455  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  50.73 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  44.71 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.88 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  45.19 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  45.37 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  45.37 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  45.37 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  45.19 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  45.37 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  45.37 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  43.9 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  44.5 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  44.39 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  42.03 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  42.71 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  43.72 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  41.15 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  42.03 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  36.45 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  40.41 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  40.49 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  39.06 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  41.76 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  40.5 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  35.03 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  37.79 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  35.2 
 
 		 205 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  43.75 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  37.57 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  34.2 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.46 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  32.16 
 
 		 203 aa  128  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  34.87 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  34.8 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  37.63 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  37.63 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  37.63 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  32.81 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  30.05 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  31.34 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  34.57 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  34 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  30.29 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  32.81 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  33.71 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  33.17 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  30.1 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  37.63 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  31.63 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  32.43 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  35.71 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  38.25 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  34.67 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  37.14 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  37.5 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  41.28 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  32.85 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  30.85 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  31.71 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.27 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  34.08 
 
 		 195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  34.9 
 
 		 200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  30.85 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  34.85 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.07 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  32.65 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  31.72 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  31.91 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  34.04 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  34.65 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  35.47 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  40.76 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  35.39 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.51 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  36.87 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  31.69 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  39.04 
 
 		 195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  53.77 
 
 		 200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  31.47 
 
 		 290 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  32.29 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  31.69 
 
 		 203 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  31.91 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  35.2 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  36 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.18 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  31.52 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.69 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  39.06 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  35.29 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  38.05 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  32.93 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  31.86 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  36.63 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  30.73 
 
 		 303 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  34.52 
 
 		 192 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  30.73 
 
 		 303 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  31.55 
 
 		 195 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  39.57 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>