235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1554 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 
211 aa  413  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  83.59 
 
 
203 aa  320  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  67.98 
 
 
204 aa  259  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  67.18 
 
 
203 aa  256  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  63.26 
 
 
216 aa  242  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  59.09 
 
 
210 aa  227  9e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  38.89 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  41.57 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  34.62 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  35.75 
 
 
197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  40.78 
 
 
219 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  35.52 
 
 
208 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  42.01 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  38.46 
 
 
205 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  38.07 
 
 
213 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  38.76 
 
 
197 aa  119  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  37.08 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  39.76 
 
 
192 aa  117  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  35.23 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  36.56 
 
 
198 aa  115  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.63 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  38.32 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.69 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  35.23 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  49.59 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  41.84 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  39.06 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  31.43 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  34.74 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  33.85 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  33.85 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  33.85 
 
 
211 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.41 
 
 
211 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  35.03 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  35.33 
 
 
198 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  34.52 
 
 
216 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  33.87 
 
 
211 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  33.87 
 
 
211 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.87 
 
 
211 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.33 
 
 
211 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  42.18 
 
 
205 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  35.75 
 
 
213 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  37.97 
 
 
206 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  35.75 
 
 
213 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  33.87 
 
 
211 aa  104  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  36.67 
 
 
205 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  36.17 
 
 
200 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.87 
 
 
198 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  37.63 
 
 
212 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  38.5 
 
 
209 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  30.98 
 
 
212 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  40.31 
 
 
303 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.72 
 
 
211 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  40.31 
 
 
196 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  37.25 
 
 
245 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  40.31 
 
 
303 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  40.31 
 
 
196 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  40.31 
 
 
303 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  46.72 
 
 
192 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  37.57 
 
 
195 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  37.57 
 
 
195 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  34.97 
 
 
207 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.78 
 
 
198 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  34.43 
 
 
207 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  40.44 
 
 
200 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  44.88 
 
 
191 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  39.44 
 
 
195 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  32.78 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  34.04 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  36.76 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  36 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  38.12 
 
 
225 aa  99  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  35.52 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  33.16 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  33.88 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  38.12 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  32.11 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  39.05 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  38.12 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  38.12 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  32.75 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  35.91 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  35.71 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0720  Xaa-Pro dipeptidase  30.11 
 
 
194 aa  96.3  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  35 
 
 
197 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  35.91 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  40.85 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  35.45 
 
 
290 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  32 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  37.86 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.13 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  32.67 
 
 
218 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  38.46 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  35.29 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  35.52 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  34.5 
 
 
274 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>