233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24840 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  46.48 
 
 
215 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  36.92 
 
 
213 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  46.96 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  40.22 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  36.36 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  43.68 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  41.01 
 
 
231 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.43 
 
 
210 aa  125  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  41.54 
 
 
209 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  43.46 
 
 
212 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  35.83 
 
 
210 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  32.37 
 
 
214 aa  122  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  37.25 
 
 
212 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  40.86 
 
 
206 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  42.86 
 
 
204 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  36.6 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  37.67 
 
 
211 aa  118  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.67 
 
 
211 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  42.79 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  43.84 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  45.69 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  47.14 
 
 
209 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.99 
 
 
211 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.99 
 
 
211 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  35.95 
 
 
211 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  36.99 
 
 
211 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  35.95 
 
 
211 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  36.99 
 
 
211 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  43.79 
 
 
212 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  46.4 
 
 
204 aa  115  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  36.3 
 
 
211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  30.1 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  35.96 
 
 
211 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  31.63 
 
 
207 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  41.35 
 
 
232 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  37.7 
 
 
201 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40.88 
 
 
204 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  39.26 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  43.09 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  43.09 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  43.09 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  46.55 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  38.2 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  46.36 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  40.76 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  40.76 
 
 
205 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  40.76 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  40.76 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  40.76 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  43.31 
 
 
204 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  47.71 
 
 
204 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  40.76 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  40.76 
 
 
204 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  43.92 
 
 
197 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  40.76 
 
 
204 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  42.22 
 
 
203 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  41.04 
 
 
203 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  52.5 
 
 
204 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  43.41 
 
 
204 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  45.3 
 
 
204 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  41.51 
 
 
209 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  42.64 
 
 
204 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  44.22 
 
 
199 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  47.71 
 
 
207 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  41.46 
 
 
218 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  47.2 
 
 
204 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  30.39 
 
 
206 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.95 
 
 
213 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  44.22 
 
 
196 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  42.52 
 
 
204 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  42.65 
 
 
207 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  44.83 
 
 
204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  42.48 
 
 
213 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  47.46 
 
 
207 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  31.51 
 
 
195 aa  103  3e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  29.65 
 
 
211 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  37.8 
 
 
198 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  49.07 
 
 
198 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  41.73 
 
 
204 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  27.65 
 
 
221 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  41.25 
 
 
222 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  43.97 
 
 
176 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  39.35 
 
 
200 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  38.68 
 
 
242 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  41.73 
 
 
204 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  43.33 
 
 
208 aa  101  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  50.83 
 
 
204 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  50.83 
 
 
204 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  45.87 
 
 
198 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  50.83 
 
 
204 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  34.21 
 
 
206 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  40.16 
 
 
204 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  33.13 
 
 
197 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  47.37 
 
 
206 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  50.83 
 
 
204 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  34.36 
 
 
219 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  37.24 
 
 
245 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  50.83 
 
 
204 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  42.57 
 
 
197 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>