237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0046 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  374  1e-103  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  52.15 
 
 
232 aa  157  6e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  39.39 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  37.35 
 
 
195 aa  108  6e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  34.84 
 
 
197 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  35.07 
 
 
197 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  34.19 
 
 
193 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  36.48 
 
 
205 aa  101  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  33.56 
 
 
192 aa  101  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  37.78 
 
 
192 aa  101  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  38.93 
 
 
211 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  37.78 
 
 
211 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  37.78 
 
 
211 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.78 
 
 
211 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  38.17 
 
 
211 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  38.17 
 
 
211 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.17 
 
 
211 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  36.13 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  35.82 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  35 
 
 
213 aa  98.2  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  41.03 
 
 
198 aa  98.2  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  28.48 
 
 
201 aa  98.2  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  38.79 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  34.53 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  38.17 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.04 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  38.79 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  42.86 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  34.62 
 
 
210 aa  95.9  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  34.51 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  34.93 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  36.3 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  38.81 
 
 
207 aa  94.7  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  36.64 
 
 
212 aa  94.4  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  34.81 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 
195 aa  93.6  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  46.23 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  35.12 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  33.95 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  35.12 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.46 
 
 
198 aa  92.4  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  38.76 
 
 
212 aa  92.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  35.54 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  28.8 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  34.55 
 
 
197 aa  92.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  32.59 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3312  hypothetical protein  35.37 
 
 
209 aa  92  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  42.06 
 
 
198 aa  91.7  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  29.78 
 
 
200 aa  91.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  35.77 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  90.5  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  37.4 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  28.93 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  28.93 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  28.74 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  29.24 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  37.14 
 
 
198 aa  89  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  32.68 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  37.93 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  28.57 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  36.64 
 
 
213 aa  88.6  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  32.87 
 
 
225 aa  88.6  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  27.54 
 
 
212 aa  87  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  30.19 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  28.48 
 
 
290 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  30.5 
 
 
213 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  30.59 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  28.3 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  28.3 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  28.3 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  36.13 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  28.98 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  26.97 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  47.73 
 
 
216 aa  84.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  27.49 
 
 
212 aa  84.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  36.3 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  26.71 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0091  hypothetical protein  30.41 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  33.51 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  37.86 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  32.89 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  35.33 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  38.69 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  25.77 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  34.44 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  34.44 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  31.95 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  25.64 
 
 
218 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  29.19 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  29.21 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  26.71 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  29.19 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  32.02 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  37.17 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  34.81 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  30.3 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  29.19 
 
 
303 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  28.75 
 
 
239 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>