238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0638 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  98.45 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  98.45 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  92.27 
 
 		 194 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  77.08 
 
 		 197 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  75 
 
 		 193 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  76.68 
 
 		 197 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  60.85 
 
 		 196 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  64.25 
 
 		 194 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  61.38 
 
 		 196 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  47.73 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  49.45 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  49.45 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  45.83 
 
 		 212 aa  166  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3312  hypothetical protein  47.25 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  47.37 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0091  hypothetical protein  48.15 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4327  hypothetical protein  50.27 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  44.16 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  47.03 
 
 		 201 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  39.9 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  39.9 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  39.9 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  41.94 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  42.47 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37283  predicted protein  44.97 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  40.53 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  38.34 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  38.3 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  40.68 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  40.11 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  34.25 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  40.68 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  38.33 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  38.33 
 
 		 290 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  40.11 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  41.49 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  41.49 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  41.49 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  40.96 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  37.3 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  40.96 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  35.9 
 
 		 203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  41.05 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  41.05 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  41.05 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  41.05 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  40.96 
 
 		 204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  41.05 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  35.42 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  38.38 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  40.96 
 
 		 204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  37.36 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  37.78 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  40.43 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  39.55 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  38.42 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  111  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  35.42 
 
 		 204 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  35.08 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  40.26 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  35.42 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  37.84 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  37.84 
 
 		 204 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  31.05 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.62 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  41.45 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.41 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  33.69 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  38.95 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  37.08 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  36.56 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  33.51 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  34.55 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  33 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  33.99 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  36.88 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  32.62 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  33.68 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  34.21 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0074  hypothetical protein  46.31 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.42 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  38.65 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  44.92 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  32.79 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  36.65 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  38.42 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  38.42 
 
 		 303 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  34.55 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  38.42 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  36.42 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  34.03 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  38.42 
 
 		 303 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  34.76 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>