225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1170 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1170  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 		 374 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  37.06 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.56 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.52 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0152  RarD protein  32.37 
 
 		 276 aa  159  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.886029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.84 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  34.17 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  34.17 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  34.17 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  34.17 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  35.11 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.75 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  40.51 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  33.67 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  33.09 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  32.65 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  32.85 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.09 
 
 		 294 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  30.48 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  30.51 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  33.09 
 
 		 294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  33.09 
 
 		 294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  34.56 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  33.92 
 
 		 294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  33.09 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  30.82 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  30.82 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  30.82 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  30.82 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  34.11 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.78 
 
 		 301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  32.87 
 
 		 296 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.78 
 
 		 301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.57 
 
 		 298 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  30.17 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.25 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  31.63 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  30.17 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  34.51 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0851  RarD protein  32.61 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0193705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  31.31 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  34.46 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  34.23 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  31.2 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  29.83 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.97 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.9 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  30.91 
 
 		 315 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0706  RarD protein  35.09 
 
 		 310 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4258  transporter DMT superfamily protein  31.07 
 
 		 327 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.33 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3149  RarD protein  32.57 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3198  hypothetical protein  32.57 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3132  RarD protein  32.57 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  30.82 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  31.16 
 
 		 300 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  30.72 
 
 		 294 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.68 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.3 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000278  RarD protein  29.7 
 
 		 301 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0706  transporter DMT superfamily protein  32.84 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010497  hitchhiker  0.00122154 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3312  RarD protein  32.45 
 
 		 304 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.74 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  32.98 
 
 		 302 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  32.32 
 
 		 304 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  31.85 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  31.85 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  31.85 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4080  transporter DMT superfamily protein  37.14 
 
 		 284 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  32.6 
 
 		 297 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  31.54 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.33 
 
 		 292 aa  136  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05888  hypothetical protein  31.23 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  31.74 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  27.67 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  30.79 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  34.49 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  36.97 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3212  RarD protein  32.56 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  31.69 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  32.66 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  32.66 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  30.14 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  29.83 
 
 		 290 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  32.66 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  33 
 
 		 298 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1861  transporter DMT superfamily protein  32.23 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  32.66 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  34.47 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  29.45 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  30.95 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.17 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  31.45 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.08 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2877  transporter DMT superfamily protein  34.67 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  30.82 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  31.45 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.44 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  31.54 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  30.95 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>