77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0284 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  70.4 
 
 
220 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  70.4 
 
 
220 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  67.84 
 
 
210 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  62.86 
 
 
208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  68.42 
 
 
196 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  68.42 
 
 
208 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  68.42 
 
 
208 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  66.84 
 
 
208 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  62.79 
 
 
215 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  62.79 
 
 
215 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  62.79 
 
 
213 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  67.39 
 
 
185 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  62.79 
 
 
249 aa  258  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  62.33 
 
 
215 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  62.33 
 
 
213 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  62.33 
 
 
213 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  62.33 
 
 
215 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  54.12 
 
 
225 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  48.58 
 
 
218 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  51.55 
 
 
218 aa  191  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  49.74 
 
 
218 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  47.47 
 
 
215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  42.86 
 
 
228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  44.15 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  39.79 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  44.44 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  40.74 
 
 
227 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  39.02 
 
 
249 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  39.02 
 
 
219 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  38.95 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  40.4 
 
 
220 aa  138  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  39.42 
 
 
220 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  39.79 
 
 
217 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  40.53 
 
 
201 aa  134  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  37.97 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  32.28 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  30.11 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  29 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  24.6 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  25.93 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  26.06 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  27.5 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  27.68 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  29.83 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  26.4 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  24.74 
 
 
181 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  27.32 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  26.84 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  26.99 
 
 
181 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  26.99 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  27.84 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  27.37 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  22.95 
 
 
181 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  27.13 
 
 
180 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  23.71 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  25.59 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  24.08 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  23.39 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  26.21 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  24.12 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  24.08 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  24.48 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  25.2 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  24.48 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  24.48 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  23.96 
 
 
181 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  21.65 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  26.21 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  22.88 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  24.49 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  24.03 
 
 
183 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  24.87 
 
 
178 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  23.24 
 
 
181 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  20.65 
 
 
203 aa  41.6  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>