62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1933 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  100 
 
 		 218 aa  448  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  77.06 
 
 		 218 aa  347  6e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  42.58 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  38.57 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  38.1 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  39.05 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  38.1 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  33.49 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  37.56 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  34.47 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  33.97 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  33.97 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  33.98 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  33.98 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  34.23 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  35.55 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  35.55 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  34.86 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  34.33 
 
 		 185 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  32.67 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  33.66 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  35.48 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  33.67 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  34.45 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  34.45 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  34.45 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  32.54 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  35.29 
 
 		 249 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  33.97 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  33.97 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  33.97 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  33.97 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  33.17 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  30.04 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  33.33 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  35.08 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  30.35 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  28.14 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  30.11 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  29.57 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  30.11 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  26.63 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  28.5 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  26.13 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  26.13 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  26.63 
 
 		 181 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  27.09 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  28.36 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  28.36 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  25.35 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  25.68 
 
 		 181 aa  51.6  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  24 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  24.31 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  32.17 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  26.51 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  26.83 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  30.51 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  28.96 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  25.6 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  23.92 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  29.51 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>