62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1638 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  77.06 
 
 		 218 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  40.95 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  42.92 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  36.67 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  36.19 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  35.41 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  36.06 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  37.56 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  35.44 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  34.93 
 
 		 196 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  35.78 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  34.95 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  34.95 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  33.97 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  35.61 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  36.1 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  33.81 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  33.81 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  34.65 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  36.32 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  35.41 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  35.41 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  35.41 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  33.03 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  32.23 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  34.93 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  34.93 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  34.93 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  34.93 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  34.3 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  33 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  36.73 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  30.49 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  31.66 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  29.7 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  28.88 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  28.88 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  26.63 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  28.34 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  27 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  25.63 
 
 		 181 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  25.13 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  25.13 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  25.13 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  27.09 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  26.44 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  22.4 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  24.73 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  25.62 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  31.13 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  25.75 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  25.49 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  31.25 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  31.3 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  25.85 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  27.38 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  23.79 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  27.45 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  22.45 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>