95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2896 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  93.75 
 
 		 208 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  93.75 
 
 		 208 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  89.9 
 
 		 210 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  94.39 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  93.75 
 
 		 208 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  74.18 
 
 		 215 aa  317  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  74.18 
 
 		 215 aa  317  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  74.65 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  74.18 
 
 		 213 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  73.24 
 
 		 215 aa  314  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  73.24 
 
 		 215 aa  314  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  73.24 
 
 		 213 aa  314  6e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  73.24 
 
 		 213 aa  314  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  62.67 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  66.18 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  62.86 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  55.84 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  50.73 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  49.76 
 
 		 218 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  49.54 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  47.89 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  44.97 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  43.16 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  45.36 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  45.36 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  44.06 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  44.44 
 
 		 227 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  41.58 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  45.4 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  41.62 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  39.58 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  39.79 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  33.49 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  34.02 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  27.69 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  30.61 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  31.12 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  24.87 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  31.52 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  30.46 
 
 		 181 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  29.44 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  30.82 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  28.12 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  28.49 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  29.15 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  28.93 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  28.93 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  27.98 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  29 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  26.94 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  28.36 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  28.64 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  26.94 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  26.94 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  29.27 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  24.12 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  24.71 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  22 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  30.06 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  21.67 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  26.11 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  24.1 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  23.5 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  27.39 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  26.88 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  24.8 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  22.45 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  26.11 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  27.39 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  26.83 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  25.58 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  23 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  29.69 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  24.42 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  21.71 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  26.83 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  26.83 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  23.68 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  23.44 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  24.55 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  26.11 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  26.11 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  20.79 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  22.37 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  21.29 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  22.37 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  29.7 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  22.58 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  24.59 
 
 		 198 aa  41.6  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  24.2 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>