78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4384 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  62.67 
 
 		 228 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  63.44 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  65.7 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  63.59 
 
 		 220 aa  268  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  63.43 
 
 		 219 aa  264  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  263  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  63.72 
 
 		 217 aa  261  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  60.26 
 
 		 239 aa  256  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  57.21 
 
 		 220 aa  235  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  64.74 
 
 		 190 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  41.27 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  41.8 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  40.74 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  44.44 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  43.39 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  43.92 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  43.39 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  43.39 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  39.9 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  41.54 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  46.56 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  46.56 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  46.56 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  43.78 
 
 		 185 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  45.5 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  45.5 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  45.5 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  45.5 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  44.97 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  42.35 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  42.35 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  41.21 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  36.56 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  34.03 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  33.97 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  34.55 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  30.53 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  26.37 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  30.65 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  29.02 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  31.25 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  27.62 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  27.32 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  26.73 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  25.26 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  29.01 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  30.19 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  27.95 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  27.17 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  26.29 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  26.29 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  28.27 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  28.99 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  25.77 
 
 		 181 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  27.22 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  24.87 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  24.87 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  24.55 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  29.27 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  24.55 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  29.27 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  27.36 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  29.27 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  22.52 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  34.51 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  25.26 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  23.88 
 
 		 183 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  26.56 
 
 		 178 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  26.53 
 
 		 196 aa  42  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  28.97 
 
 		 211 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>