94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0552 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  95 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  70.4 
 
 		 223 aa  335  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  64.55 
 
 		 210 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  66.18 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  68.42 
 
 		 196 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  68.42 
 
 		 208 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  68.42 
 
 		 208 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  68.42 
 
 		 208 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  68.65 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  60.91 
 
 		 215 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  60.91 
 
 		 215 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  60.91 
 
 		 213 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  60.45 
 
 		 215 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  60.45 
 
 		 213 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  60.45 
 
 		 215 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  60.45 
 
 		 213 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  60.91 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  48.21 
 
 		 225 aa  217  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  48.61 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  47.22 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  49.76 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  49.74 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  42.33 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  41.8 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  39.59 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  38.54 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  43.01 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  42.59 
 
 		 190 aa  148  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  38.74 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  39.68 
 
 		 249 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  41.27 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  39.15 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  39.15 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  36.32 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  39.67 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  32.67 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  34.57 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  26.94 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  27.81 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  29.82 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  26.02 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  27.67 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  28.95 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  28.95 
 
 		 181 aa  62  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  29.17 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  29.91 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  28.93 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  28.65 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  28.65 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  27.75 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  26.94 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  28.5 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  26.94 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  25.14 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  26.94 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  26.42 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  24.49 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  26.49 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  26.7 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  22.75 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  26.4 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  23.18 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  23.18 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  23.18 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  24.61 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  21.62 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  26.52 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  23.78 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2403  hypothetical protein  23.46 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  22.77 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  21.39 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  24.39 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  26.67 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  23.44 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  22.94 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  26.81 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  20 
 
 		 199 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  23.33 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  23.19 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  20.69 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  24.42 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  22.44 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  27.4 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  40.48 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  22 
 
 		 197 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  24.42 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  22 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  40.48 
 
 		 276 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  22 
 
 		 196 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  40.48 
 
 		 276 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>