76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3797 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  366  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  98.9 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  98.34 
 
 		 181 aa  358  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  87.29 
 
 		 181 aa  327  8e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  81.22 
 
 		 181 aa  306  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  81.77 
 
 		 181 aa  306  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  81.22 
 
 		 181 aa  306  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  80.66 
 
 		 181 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  74.59 
 
 		 181 aa  284  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  61.64 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  60 
 
 		 181 aa  201  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  56.11 
 
 		 180 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  56.11 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  54.34 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  58.6 
 
 		 183 aa  191  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0252  hypothetical protein  52.75 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  42.54 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  41.07 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  36.02 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  33.91 
 
 		 167 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0231  hypothetical protein  32.64 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  27.23 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  28.65 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  31.4 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  30.11 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2712  transmembrane cytochrome oxidase associated protein  28.24 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  35.38 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  35.38 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  28.8 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  34.71 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  30.35 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  33.74 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  32.16 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  29.57 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  29.57 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  25.52 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  28.99 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  25.52 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  27.67 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  27.32 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  26.94 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  27.5 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  27.23 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  26.37 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  26.37 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  31.29 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  26.94 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  26.94 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  27.84 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  25 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  29.23 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  22.75 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  26 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  24.86 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  26.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  25.51 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  27.01 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1044  hypothetical protein  28.85 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  26.16 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2403  hypothetical protein  29.28 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  28.79 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  30.28 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  30.28 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  23.96 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  31.68 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  23.63 
 
 		 249 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  26.29 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  23.63 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  23.63 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  23.63 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  27 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  28.83 
 
 		 220 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  22.58 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>