62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3901 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  436  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  70.59 
 
 
249 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  70.59 
 
 
219 aa  310  7.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  64.35 
 
 
228 aa  292  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  66.36 
 
 
217 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  66.36 
 
 
227 aa  264  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  66.33 
 
 
210 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  61.29 
 
 
220 aa  255  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  65.62 
 
 
190 aa  228  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  55.05 
 
 
239 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  50.69 
 
 
220 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  39.79 
 
 
223 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  38.54 
 
 
220 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  39.58 
 
 
220 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  44.72 
 
 
218 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  44.22 
 
 
218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  44.27 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  45.31 
 
 
213 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  45.31 
 
 
215 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  45.31 
 
 
215 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  39.58 
 
 
208 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  44.27 
 
 
215 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  44.27 
 
 
215 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  44.27 
 
 
213 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  44.27 
 
 
213 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  44.22 
 
 
215 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  39.58 
 
 
196 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  39.58 
 
 
208 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  39.58 
 
 
208 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  39.58 
 
 
208 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  38.02 
 
 
210 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  38.5 
 
 
225 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  40.5 
 
 
218 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  40.33 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  36.98 
 
 
195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  31.66 
 
 
201 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  31.22 
 
 
218 aa  98.2  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  34.55 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  26.4 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  29.38 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  34.97 
 
 
192 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  28.8 
 
 
181 aa  58.5  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  27.04 
 
 
181 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  27.41 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  27.04 
 
 
181 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  30.56 
 
 
193 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  25.51 
 
 
181 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  27.04 
 
 
181 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  25.51 
 
 
181 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  27.04 
 
 
181 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  25.51 
 
 
181 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  27.18 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  29.6 
 
 
180 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  27.27 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  22.82 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  26.67 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  22.77 
 
 
181 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  27 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  25.64 
 
 
181 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  20.79 
 
 
180 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>