93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6169 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  93.75 
 
 
208 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  89.42 
 
 
210 aa  394  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  95.67 
 
 
208 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  95.92 
 
 
196 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  95.67 
 
 
208 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  94.05 
 
 
185 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  74.65 
 
 
249 aa  316  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  73.24 
 
 
215 aa  314  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  73.24 
 
 
215 aa  314  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  73.24 
 
 
213 aa  313  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  72.3 
 
 
213 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  72.3 
 
 
215 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  72.3 
 
 
215 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  72.3 
 
 
213 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  65.69 
 
 
220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  62.21 
 
 
220 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  62.38 
 
 
223 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  56.85 
 
 
225 aa  225  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  50.24 
 
 
218 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  49.27 
 
 
218 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  50.93 
 
 
218 aa  204  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  49.3 
 
 
215 aa  194  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  40 
 
 
228 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  43.68 
 
 
239 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  44.44 
 
 
210 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  41.03 
 
 
201 aa  148  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  44.86 
 
 
220 aa  147  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  42.41 
 
 
249 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  42.41 
 
 
219 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  41.58 
 
 
217 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  45.4 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  42.86 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  39.58 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  39.27 
 
 
220 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  40.54 
 
 
195 aa  131  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  34.45 
 
 
218 aa  108  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  34.54 
 
 
218 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  27.92 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  30.43 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  29.59 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  29.59 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  24.34 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  30.17 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  28.85 
 
 
192 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  26.74 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  27.5 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  29 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  27.41 
 
 
181 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  26.9 
 
 
181 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  27.5 
 
 
181 aa  58.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  27.5 
 
 
181 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  26.9 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  26.9 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  26.9 
 
 
181 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  27.5 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  28.06 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  28.78 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  25.13 
 
 
178 aa  52  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  27.36 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  21.76 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  28.71 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  21.11 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  28.71 
 
 
193 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  28.37 
 
 
193 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  25.68 
 
 
183 aa  48.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  23.12 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  26.75 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  29.27 
 
 
210 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  26.75 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  22.95 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  28.91 
 
 
180 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  24.12 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  23.89 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  24.4 
 
 
180 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  24.34 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  26.25 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 
197 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  22.67 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  26.75 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0231  hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12557  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  23.78 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  23.83 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  28.66 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  26.79 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  23.84 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1511  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.85 
 
 
161 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  21.43 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  23.03 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  26.75 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2403  hypothetical protein  22.34 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  23.12 
 
 
181 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  20.2 
 
 
218 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>