70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2852 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  98.63 
 
 		 249 aa  440  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  70.59 
 
 		 221 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  67.29 
 
 		 217 aa  279  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  62.79 
 
 		 228 aa  277  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  65.42 
 
 		 220 aa  271  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  63.89 
 
 		 227 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  64.29 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  56.94 
 
 		 220 aa  234  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  64.92 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  53.24 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  45.36 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  42.93 
 
 		 196 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  42.93 
 
 		 208 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  42.93 
 
 		 208 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  42.41 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  45.63 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  46.12 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  46.12 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  46.12 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  42.41 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  39.15 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  40.74 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  45.15 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  46.56 
 
 		 185 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  45.15 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  45.15 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  45.15 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  39.02 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  41.84 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  43.37 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  43.37 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  42.13 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  35.03 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  36.51 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  36.49 
 
 		 218 aa  104  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  35.6 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  33.16 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  27.69 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  32.53 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  29.47 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  32.45 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  27.64 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  28.14 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  28.14 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  29.53 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  27.86 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  26.87 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  26.87 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  26.37 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  25.87 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  29.02 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  25.76 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  30.52 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  27.53 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  27.72 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  27.56 
 
 		 180 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  28 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  25.13 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  24.75 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  26.73 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  22.44 
 
 		 180 aa  45.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  24.38 
 
 		 181 aa  45.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  23.93 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  24.35 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  26.26 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  26.74 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  24.44 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  23.03 
 
 		 181 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>