66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3004 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  35.33 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  32.96 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  30.85 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  33.16 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  33.16 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  26.7 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  32.98 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  27.81 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  29.41 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  28.88 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  30.1 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  26.24 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  30.1 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  27.67 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  29.26 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  24.87 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  29.38 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  28.18 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  31.58 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  30.05 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  24.35 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  30.65 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  28.72 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  25.93 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  26.7 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  25.71 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  26.2 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  26.2 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  28.12 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  28.02 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  26.2 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  26.74 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  26.86 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  28.8 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  26.86 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  26.86 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  26.86 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  27.89 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  26.29 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  26.29 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  26.29 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  30.48 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  26.29 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  31.97 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  30.71 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  29.32 
 
 		 181 aa  52  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  30.08 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  27.23 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  27.45 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  26.51 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  25.3 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  26.23 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  45.24 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  30.22 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  29.38 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  27.89 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  34.83 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  27.37 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  27.37 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  26.84 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0823  electron transport protein SCO1/SenC  53.33 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108097  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  27 
 
 		 181 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  26.53 
 
 		 181 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  27 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>