70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0885 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  81.58 
 
 		 210 aa  325  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  66.84 
 
 		 228 aa  263  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  65.62 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  65.45 
 
 		 249 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  61.05 
 
 		 220 aa  237  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  64.74 
 
 		 227 aa  236  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  62.63 
 
 		 217 aa  236  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  64.92 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  57.51 
 
 		 239 aa  222  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  57.51 
 
 		 220 aa  217  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  41.62 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  42.16 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  42.7 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  42.78 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  45.45 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  44.62 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  44.62 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  44.62 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  44.09 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  43.55 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  43.55 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  44.62 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  46.28 
 
 		 218 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  44.57 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  44.57 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  44.57 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  44 
 
 		 215 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  44 
 
 		 215 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  45.74 
 
 		 218 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  44 
 
 		 213 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  44 
 
 		 213 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  43.43 
 
 		 249 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  45.6 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  38.8 
 
 		 195 aa  121  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  36.07 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  29.9 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  35.08 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  37.58 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  28.42 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  27.03 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  31.33 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  27.03 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  26.26 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  27.57 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  33.97 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  27.96 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  26.49 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  27.96 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  27.42 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  32.14 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  27.81 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  26.49 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  27.17 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  26.97 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  27.17 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  27.04 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  25 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  28.48 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  27.89 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  23.81 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  25.31 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  26.67 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  26.18 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  23.6 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  25.14 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  25.2 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  25 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  23.35 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>