65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3826 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  59.45 
 
 		 239 aa  259  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  56.82 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  54.05 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  56.94 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  59.5 
 
 		 210 aa  227  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  55.96 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  57.21 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  55.09 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  56.48 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  50.69 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  43.01 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  44.5 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  44.86 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  44.06 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  43.55 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  43.78 
 
 		 196 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  43.78 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  43.78 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  44.81 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  41.67 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  45.99 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  45.99 
 
 		 215 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  45.99 
 
 		 215 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  40.4 
 
 		 223 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  45.45 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  45.45 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  45.45 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  45.45 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  44.1 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  45.41 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  43.59 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  41.54 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  36.84 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  44.04 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  35.64 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  35.61 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  34.86 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  36.84 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  26.56 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  26.7 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  32.76 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  28.72 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  30.58 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  25.52 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  27.69 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  26.88 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  24.59 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  25.58 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  23.08 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  24.75 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  26.42 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  25.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  27.78 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  27.78 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  27.78 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  28.83 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  28.81 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  25.93 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  28.81 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  28.81 
 
 		 193 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  27.16 
 
 		 181 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  28.83 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  28.83 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  27.97 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>