87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0190 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  100 
 
 
201 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  40.66 
 
 
195 aa  155  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  42.11 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  38.46 
 
 
208 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  41.05 
 
 
208 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  41.05 
 
 
208 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  40.31 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  39.67 
 
 
185 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  36.32 
 
 
220 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  40.53 
 
 
223 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  36.92 
 
 
218 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  35.79 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  36.41 
 
 
218 aa  131  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  38.86 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  42.11 
 
 
249 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  39.66 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  39.66 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  39.66 
 
 
213 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  39.66 
 
 
213 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  39.66 
 
 
213 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  39.66 
 
 
215 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  39.66 
 
 
215 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  32 
 
 
239 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  34.52 
 
 
225 aa  124  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  36.84 
 
 
220 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  36.68 
 
 
215 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  35.26 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  34.55 
 
 
249 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  33.5 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  35.4 
 
 
190 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  33.5 
 
 
219 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  35.08 
 
 
228 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  34.72 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  31.07 
 
 
204 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  31.31 
 
 
221 aa  94.7  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  34.03 
 
 
227 aa  92  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  26.09 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  30.35 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  28.88 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  25.6 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  26.94 
 
 
192 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  27.04 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  24.37 
 
 
181 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  26.04 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  26.04 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  26.04 
 
 
181 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  25.79 
 
 
189 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  25.25 
 
 
181 aa  51.2  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  27.78 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  23.76 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  23.27 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  23.98 
 
 
180 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  26.19 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  24.02 
 
 
181 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  23.76 
 
 
181 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  25.26 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  26.11 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 
209 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  22.8 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  22.8 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  27.39 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  27.39 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  27.39 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  24.75 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  24.37 
 
 
188 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  21.79 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  24.67 
 
 
199 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  23.56 
 
 
195 aa  44.7  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  27.59 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  22.34 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  23.84 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  24.06 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  23.36 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  22 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2403  hypothetical protein  22.68 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  22.08 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  21.9 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  23.26 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  24 
 
 
199 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  22.09 
 
 
194 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  23.26 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  27.59 
 
 
210 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  21.43 
 
 
181 aa  41.2  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>