80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1430 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  99.07 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  99.07 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  99.06 
 
 
213 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  91.63 
 
 
249 aa  387  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  73.24 
 
 
208 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  75.12 
 
 
208 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  77.27 
 
 
196 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  75.12 
 
 
208 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  77.37 
 
 
208 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  72.56 
 
 
210 aa  323  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  78.38 
 
 
185 aa  316  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  60.91 
 
 
220 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  60.45 
 
 
220 aa  287  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  62.33 
 
 
223 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  52.05 
 
 
225 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  51.36 
 
 
218 aa  207  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  51.36 
 
 
218 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  53.61 
 
 
218 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  50.68 
 
 
215 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  46.03 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  48.15 
 
 
210 aa  168  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  47.57 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  45.15 
 
 
219 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  45.15 
 
 
249 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  44.92 
 
 
239 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  45.5 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  43.98 
 
 
220 aa  151  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  45.45 
 
 
220 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  44.27 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  45.68 
 
 
190 aa  144  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  40 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  37.97 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  33.97 
 
 
218 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  33.85 
 
 
218 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  25.94 
 
 
204 aa  85.1  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  28.86 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  27.59 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  32.22 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  28.21 
 
 
192 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  28.21 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  28.21 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  28.28 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  26.32 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  26.7 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  27.84 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  26.32 
 
 
181 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  26.44 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  27.46 
 
 
181 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  27.97 
 
 
220 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  26.32 
 
 
181 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  27.08 
 
 
181 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  26.32 
 
 
181 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  28.28 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  28.48 
 
 
180 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  22.56 
 
 
178 aa  48.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  26.4 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  23.39 
 
 
219 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  26.67 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  27.69 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  24.48 
 
 
181 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  24.48 
 
 
181 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  24.48 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  23.26 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  22.4 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  25.5 
 
 
180 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  23.26 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  25.43 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  23.84 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  21.62 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  24.46 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  22.98 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  23.63 
 
 
183 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  27.27 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  31.08 
 
 
210 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>