64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06266 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  362  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  67.42 
 
 
178 aa  263  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  42.77 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  43.2 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  39.78 
 
 
181 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  40.56 
 
 
181 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  40.33 
 
 
181 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  39.39 
 
 
180 aa  120  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  39.13 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  41.67 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  41.51 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  41.07 
 
 
181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  41.07 
 
 
181 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  40.12 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  39.87 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0252  hypothetical protein  36.47 
 
 
183 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  29.73 
 
 
186 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0231  hypothetical protein  32.4 
 
 
211 aa  97.4  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  30.51 
 
 
167 aa  87  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  30.81 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  30.65 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  30.27 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  29.08 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  30.62 
 
 
204 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  25.5 
 
 
225 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  23.53 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  23.53 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  26.6 
 
 
191 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  30.48 
 
 
216 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  24.75 
 
 
218 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  25.13 
 
 
218 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  24.24 
 
 
218 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  27.75 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  25.31 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  26.86 
 
 
213 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  25.95 
 
 
193 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  27.13 
 
 
193 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  29.59 
 
 
228 aa  51.2  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1044  hypothetical protein  27.03 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  25.95 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  26.4 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  26.9 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  25 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  25.95 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  25.26 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  23.12 
 
 
196 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  26.15 
 
 
220 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  22.96 
 
 
208 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  22.96 
 
 
208 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  24.24 
 
 
215 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  22.96 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  26.63 
 
 
189 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  23.12 
 
 
210 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  23 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  24.87 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  22.68 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  30.58 
 
 
218 aa  44.7  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2712  transmembrane cytochrome oxidase associated protein  22.22 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  27.06 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  24.87 
 
 
223 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  25.26 
 
 
210 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  29.51 
 
 
218 aa  41.2  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>