55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04007 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  338  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  51.15 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  39.02 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  38.55 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  36.09 
 
 		 180 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  36.47 
 
 		 196 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0252  hypothetical protein  35.15 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  33.91 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  34.32 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  33.91 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  33.73 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  33.73 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0231  hypothetical protein  31.4 
 
 		 211 aa  94.4  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12557  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  33.73 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  33.73 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  33.14 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  30.51 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  31.98 
 
 		 178 aa  87.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  30.93 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  25 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  27.65 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  27.61 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  26.28 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  26.28 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  27.65 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  26.28 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  26.58 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  26.58 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  26.82 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  23.43 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  27.13 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  27 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  25.14 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  34.57 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  22.86 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1044  hypothetical protein  23.3 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2712  transmembrane cytochrome oxidase associated protein  23.95 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  26.32 
 
 		 206 aa  47.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  28.15 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  28.15 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  27.48 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  25.77 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  24.54 
 
 		 219 aa  44.3  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  28.96 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  24.54 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  28.22 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  22.47 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  29.2 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  24.74 
 
 		 216 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  23.31 
 
 		 201 aa  40.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>