22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1044 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1044  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  28.06 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  29.23 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2712  transmembrane cytochrome oxidase associated protein  27.17 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  27.27 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  31.73 
 
 
181 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  26.86 
 
 
181 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  27.03 
 
 
178 aa  51.2  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  23.3 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  26.74 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  27.96 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  28.85 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  29.49 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  28.85 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  27.72 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  27.13 
 
 
181 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  25.39 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  24.12 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  23.68 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  27.78 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  25.51 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  25.68 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>