55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4240 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  51.15 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  38.92 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  36.02 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  37.77 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  36.02 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  36.56 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  38.38 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  38.38 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  32.97 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  36.56 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  36.61 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0231  hypothetical protein  35.52 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  32.75 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  35.98 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  29.73 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0252  hypothetical protein  33.14 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  37.58 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  31.89 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  29 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  26.52 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  27.98 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  24.19 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  26.79 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1044  hypothetical protein  28.06 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  26.56 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  24.48 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  25.73 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  23.27 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  25.19 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  26.16 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  29.13 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  26.16 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  27.65 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  24.43 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  25.12 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  27.32 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2712  transmembrane cytochrome oxidase associated protein  25.56 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  23.37 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  23.37 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  26.78 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  25.76 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  25.31 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  22.63 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  22.84 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  27.07 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  24.75 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  25.81 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  22.44 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  23.27 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  26.53 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  23.38 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  22.73 
 
 		 219 aa  41.2  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>