27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0477 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  99.45 
 
 
181 aa  363  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  24.87 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  23.53 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  26.26 
 
 
189 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0231  hypothetical protein  32.47 
 
 
211 aa  57.8  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  23.71 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  25.15 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  34.57 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  27.32 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2403  hypothetical protein  24.71 
 
 
199 aa  51.6  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  27.87 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  23.44 
 
 
225 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  22.8 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  26.92 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  23.2 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  30.28 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  30.28 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  30.28 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  26.98 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  23.83 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  25 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  26.32 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  30.48 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  19.41 
 
 
193 aa  41.2  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  21.65 
 
 
239 aa  41.2  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>