51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2403 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2403  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  407  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  28.04 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  28.92 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  26.26 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  24.62 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0477  hypothetical protein  26.49 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0453  hypothetical protein  26.49 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  25.43 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  28.72 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  27.13 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  25.26 
 
 
220 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  30.61 
 
 
181 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  24.04 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  28.99 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  28.99 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  24.21 
 
 
220 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  31.16 
 
 
181 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  26.6 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  29.17 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  28.37 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  24 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  22.73 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  28.37 
 
 
181 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  27.4 
 
 
181 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  24.5 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  21.72 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  27.88 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  21.72 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  24.5 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  21.72 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  22.28 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  22.28 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  21.84 
 
 
223 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  24.74 
 
 
196 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  22.65 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2712  transmembrane cytochrome oxidase associated protein  33.33 
 
 
166 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3529  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  45.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0530138  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  23.98 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  21.2 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  21.2 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  21.31 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  29.35 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  21.31 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  25.31 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  25.67 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2852  hypothetical protein  23.94 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.484652  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  23.83 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  19.9 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  28.02 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  26.4 
 
 
178 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  27.93 
 
 
193 aa  41.6  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>